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真核細胞rna提取的實驗報告

真核細胞rna提取的實驗報告

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  一.原理

  本方法利用鹽酸胍抑制RNA酶,勻漿裂解細胞,採用有機溶劑抽提去除蛋白質。透過選擇性沉澱RNA分子去除DNA。

  二.方法

  1.樣品處理

  ⑴組織樣品處理:取新鮮的組織樣品稱重後,剪碎成約1cm2的組織塊直接加入勻漿液中進行RNA提取,或液氮中速凍-70℃儲存。

  ⑵貼壁培養細胞處理:用PBS洗細胞一次,吸乾溶液後將培養板快速移至液氮中冷凍後轉到-70℃儲存;或加入1ml勻漿至培養板中直接裂解細胞,然後將粘稠的裂解液進一步勻漿。

  ⑶懸浮培養細胞處理:離心收集細胞,用PHS懸浮漂洗再田心收集,若不立即提取RNA,則可經液氮速凍後轉至一70℃貯存備用。

  2.加l倍體積鹽酸胍勻漿液[至準備好的樣品細胞中,高速勻漿1min。

  3.勻漿液5000g,室溫離心10min。

  4.將上清移至一個乾淨離心管中,加入0.1體積的3mol/L乙酸鈉(PH5.2),混勻,再加5體積預冷的乙醇,立即充分混勻,-20℃放置至少2小時。

  5.5000g0℃離心10分鐘沉澱核酸,棄上清液,室溫乾燥。

  6,每個提取RNA的組織或細胞樣品中,加入l0~15min鹽酸胍勻漿液Ⅱ,攪拌溶解。

  7.加入2.5體積預冷的乙醇,立即充分混勻,-20℃至少放置2小時。

  8.5000g0℃離心10分鐘沉澱核酸,去上清,室溫揮發乙醇。

  9.按每克組織細胞加5min的比例.分兩次加入0.02mol/LEDTA(pH8.0)先加1/2體積EDTA振盪l~2分鐘,3000g離心2min.吸出上清.再加另一個1/2體積的EDTA振盪l一2分鐘.合併兩次核酸溶解液。.

  10.用等體積氯仿—正丁醇(4:1)抽提核酸溶液,5000g室溫離心l0min,5000g室溫離心10min。吸出上清至另一個乾淨離心管中。

  11.加3倍體積lmol/L乙酸鈉(PH7.0)混勻,-20℃放置1h以上,此時RNA將選擇地沉澱,而DNA仍為溶解狀況。

  12.5000g,0℃離心20min,沉於管底的是RNA。

  13.吸去上清,用4℃預冷的'lmol/L乙酸鈉(pH7.0)漂洗RNA沉澱。然後20℃5000g,離心20分鐘。回收RNA。

  14.儘量去除上清液。按每g組織細胞1m的比例加入RNA溶解液(0.2%SDS,0.5%mol/LEDTA,pH8.0)。注意:若有SDS沉澱析出.滴加0.11mol/LNaOH調溶液pH至7.5。

  15.加入2倍體積冰預冷乙醇混勻,0℃放置至少2小時,5000g,4℃離心10分鐘,RNA沉澱用70%乙醇漂洗,短暫離心後,棄上清,室溫乾燥蒸發乙醇。

  16.用適當小容積DEPC處理過的ddH2O溶解RNA沉澱,加入3倍體積乙醇,

  -70℃儲存RNA備用。用時.加入0.1體積的3mol/L乙酸鈉,混勻,120xxg,4℃離心回收RNA。

  三.試劑

  1.鹽酸胍勻漿液Ⅰ

  成分:8mol/L鹽酸胍(分子量為95.6),O.1mol/L乙酸鈉(pH5.2),5mmol/L2—巰基乙醇,0.5%十二烷基肌氨酸鈉

  配製方法:取191g鹽酸胍.加8.35m13mol/L乙酸鈉(pH5.2)和6.25ml0.2mol/L2—琉基乙醇溶液中,再加水至237.5ml,混勻後加12.5ml10%十二烷基肌氨酸鈉,振盪混勻溶解。

  2.鹽酸胍勻漿液Ⅱ

  成分:8mol/L鹽酸胍(分子量力95.6),0.1mol/L乙酸鈉(pH5.2),1mmol/L2

  —琉基乙醇,20mmol/LEDTA(pH8.0)

  配製方法:取191g鹽酸胍,加日.35ml3mol/I。乙酸鈉(pH5.2)和1.25ml0.2mol

  /L2—巰基乙醇溶液中,再加入10ml0.5mol/LEDTA(pH8.0)。加水至250ml混勻。

  3.乙醇

  4.70%乙醇

  5.氯仿—正丁醇(4:l,體積比)

  6.4mol/L乙醇鈉,pH7.0

  7.3mol/L乙醇鈉,pH5.2

  8.RNA溶解液

  成分:O.2%SDS.0.05mol/LEDTA,pH8.0

  四、說明

  提取RNA時,要特別注意防止RNase的汙染,所用玻璃器皿均應用0.1%的二乙基焦碳酸鹽(diethylpyrocarbonate,DEPC)處理。塑膠器材均使用一次性用品,並高壓滅菌處理,必要時,也可用0.1%DEPC處理。

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