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分子生物學的名字詳解

分子生物學的名字詳解

  基因與基因組

  Gene基因:基因是DNA分子上具有遺傳效應的特定核苷酸序列的總稱,是具有遺傳效應的DNA分子片段。

  interruptesd或discontinuousgene不連續基因:真核生物的基因編碼順序在DNA分子上是不連續的,被非編碼順序隔開。

  Exon外顯子:是一個基因表達多肽鏈的部分。

  Intron內含子:內含子只轉錄,在前mRNA(pre-mNRA)時被剪下掉。Promoter啟動子:能促進轉錄過程。

  Microarray微陣列:大規模快速檢測基因差異表達、基因組表達譜、DNA序列多型性、致病基因或疾病相關基因的一項研究基因功能的新技術。

  Geneknockin基因敲入:轉基因(基因過表達)。

  Geneknockout基因敲除;又稱基因打靶(genetargeting):用外源DNA與受體細胞基因組中順序相同或者非常相近的基因發生同源重組,整合,使特定的基因失活或缺失的技術。genemutation基因突變:從分子水平上看,基因突變是指基因在結構上發生鹼基對組成或排列順序的改變。

  pointmutation點突變:由於DNA鹼基對的置換、增添或缺失而引起的基因結構的變化,亦稱點突變。

  genedisease基因病:是指基因突變或其表達調控障礙引起的疾病。

  overlappinggene基因重疊:即同一段DN段能夠編碼兩種甚至三種蛋白質分子。Genefamily基因家簇:有許多來源相同、結構相似、功能相關的基因組成為單一基因簇或基因家簇。

  supergengfamily超基因家族:更大的基因家族,起源於相同的祖先基因,功能卻並不相同。

  Pseudogenes假基因:DNA序列與功能基因相似但不產生有功能的基因產物。

  Telomere端粒:以線性染色體形式存在的真核基因組DNA末端膨大結構,稱為端粒。humangenomics人類基因組

  DNAFingerprintDNA指紋技術:DNA指紋技術作為一種遺傳標記。

  複製、損傷和修復

  Replication,DNAbiosynthesisDNA的複製:指DNA雙鏈在細胞分裂以前進行的複製過程。semi-conservativereplicationDNA的半保留複製:DNA在複製時,以親代DNA的每一股作模板,合成完全相同的兩個雙鏈子代DNA,每個子代DNA中都含有一股親代DNA鏈。Primer引物:常是RNA

  primase,DnaG引物酶:用於合成複製所必需的RNA引物。

  HelicaseDnaB解螺旋酶:由DnaA和DnaC協助在複製的起始點(OriC)上解開雙螺旋。Ori複製起始點:DNA複製要從DNA分子的特定部位開始,此部位稱複製起始點。DNApolymeraseDNA聚合酶:依賴於DNA的DNA聚合酶。

  topoisomeraseI、II拓撲異構酶:使DNA鏈發生斷裂和再連線,引入負超螺旋。SSB單鏈DNA結合蛋白:防止單鏈DNA重新形成雙鏈,防止單鏈DNA被核酸酶水解。Primosome引發體:包括解螺旋酶、DnaC、引物酶及DNA複製的起始區域。

  Telemer端粒:指真核生物染色體線性DNA分子末端的結構。

  semi-discontinuousreplication半不連續複製:領頭鏈連續複製而隨從鏈不連續複製,就是複製的半不連續性。

  Replicon基因組能獨立進行復制的功能單位稱為複製子。

  leadingstrand領頭鏈:以3'→5'方向的親代DNA鏈作模板的子代鏈在複製時基本上是連續進行的,其子代鏈的聚合方向為5'→3',這一條鏈被稱為領頭鏈。

  laggingstrand隨從鏈:而以5'→3'方向的親代DNA鏈為模板的子代鏈在複製時則是不連續的,其鏈的聚合方向也是5'→3',這條鏈被稱為隨從鏈。Okazakifragment岡崎片段:DNA在複製時,由隨從鏈所形成的一些子代DNA短鏈稱為岡崎片段。

  LigaseDNA連線酶:將不連續的DN段以3’,5’磷酸二酯鍵連線起來。

  Telomerase端粒酶:端粒酶是一種RNA-蛋白質複合體,它可以其RNA為模板,透過逆轉錄過程對末端DNA鏈進行延長。

  Telomere端粒:染色體線性DNA分子末端。

  D-loopreplicationD環複製:是線粒體DNA(mitochondrialDNA,mtDNA)的複製形式。Mutation突變:由自發的或環境的因素引起DNA一級結構的任何異常的改變稱為DNA的損傷,也稱為突變。

  lightrepairing光復活:這是一種廣泛存在的修復作用。光復活能夠修復任何嘧啶二聚體的損傷。

  excisionrepairing切除修復:這也是一種廣泛存在的修復機制,可適用於多種DNA損傷的

  修復。(參與酶:外切酶,聚合酶,連線酶)

  recombinationrepairing重組修復:這是DNA的複製過程中所採用的一種有差錯的修復方式。

  SOSSOS修復:DNA分子受到長片段高密度損傷,使DNA複製過程在損傷部位受到抑制。損傷誘導一種特異性較低的新的DNA聚合酶,以及重組酶等的產生。由這些特異性較低的酶繼續催化損傷部位DNA的複製,複製完成後,保留許多錯誤的鹼基,從而造成突變。

  inverserestrictionsitemutation,iRSM反向限制性酶切位點突變分析法:iRSM適用於快速檢測誘變劑所致體內外DNA的突變,這些突變的特點是使某一酶切位點變為另一酶切位點。

  轉錄及其調控

  Transcription轉錄:遺傳資訊由DNA轉換到RNA的過程。

  templatestrand模板鏈:指導RNA合成的`一股DNA鏈稱為模板鏈。

  codingstrand編碼鏈:與之相對的另一股鏈。

  RNApolymeraseRNA聚合酶:以DNA為模板轉錄產生互補RNA的酶(不需要引物,無校對功能)

  cis-actingelement順式作用元件:轉錄起始前的上游區具有啟動子核心序列。不同物種、不同細胞或不同的基因轉錄起始點上游有不同的DNA序列。(包括啟動子,啟動子上游元件和增強子)

  trans-actingfactors反式作用因子:能直接、間接辨認和結合轉錄上游區段DNA的蛋白質。

  transcriptionalfactors,TF轉錄因子:反式作用因子中,直接或間接結合RNA聚合酶的蛋白質。

  pre-initiationcomplex,PIC轉錄起始複合物:真核生物RNA聚合酶不與DNA分子直接結合,而需依靠眾多的轉錄因子,形成轉錄起始複合物。

  hnRNAmRNA前體

  splicing剪接

  Extron外顯子:RNA中被剪接後仍然存在能夠編碼表達蛋白質的序列,同時可以指相應的DNA序列。RNAeditingRNA編輯:RNA編輯是指在mRNA水平上改變遺傳資訊的過程。

  ControlofProkaryoticGeneExepression原核生物轉錄調控:主要在轉錄起始水平調控Opron操縱子:一個基因簇受到同一的調控,這一個完整的調節系統包括結構基因和控制這些基因表達的元件,形成了一個共同的調節單位,這種調節單位就稱為操縱子。

  Positiveregulation正調控:誘導物與蛋白質結合形成啟用子複合物,啟用子複合物與基因啟動子DNA序列結合,啟用基因啟動轉錄,成為正調控。

  Negativeregulation負調控:阻遏蛋白分子與基因啟動子DNA序列結合,阻礙RNA聚合酶的工作,使基因處於關閉狀態,成為負調控。

  Induction誘導:特殊底物的存在導致了酶的合成。

  inducibleoperon可誘導操縱子:在缺乏誘導物時,這類操縱子只有本底水平的表達,約為誘導時表達水平的0.1%左右。

  tryptophaneoperon色氨酸操縱子:一種衰減調控模式,Trp足夠時,操縱子自動關閉,Trp缺乏時,操縱子被開啟,產生酶催化合成Trp。

  Attenuator衰減調控:當Trp達到一定濃度,但還沒有高到能夠活化R使其起阻遏作用的程度時,產生Trp合成酶類的量已經明顯降低,而且產生的酶量與Trp濃度呈負相關。Enhancer增強子:遠離轉錄起始點,決定基因的時間、空間特異性表達、增強啟動子轉錄活動的DNA序列。Silencer沉默子:負性調節元件,是負調節蛋白的結合位點。Insulator絕緣子:阻止啟用或阻遏作用在染色體上的傳遞,使染色體活性限定在結構域內。Helisx-turn-helixHTH螺旋-轉角-螺旋:最常見DNA結合域之一,α螺旋識別、進入DNA雙路選結構的大溝。

  Zinc-finger鋅指:

  Leucine-zippers亮氨酸拉鍊:一段肽鏈中每隔7個AA即有一個leuα螺旋。

  翻譯及調控

  proteinbiosynthesis蛋白質生物合成:是指DNA結構基因中貯存的遺傳資訊,透過轉錄生成mRNA,再指導多肽鏈合成的過程。蛋白質的生物合成過程也稱為翻譯(translation)。

  Degeneracy簡併性:多數氨基酸擁有一個以上的密碼子;多少與該氨基酸在生物中的利用度相關。

  Wobble擺動性:密碼子與反密碼子配對的擺動現象。

  geneticcode遺傳密碼:

  readingframes閱讀框架:mRNA中的一段含有翻譯密碼的鹼基序列。

  開放閱讀框架:從起始密碼AUG開始到終止密碼子處的正確可讀序列。

  Initiation起始:mRNA、起始氨基醯-tRNA分別與核糖體結合而形成翻譯起始複合物的過程。

  Elongation延伸:在mRNA密碼序列的指導下,由特異tRNA攜帶相應氨基酸運至核糖體的受位,使肽鏈依次從N端向C端逐漸延伸的過程。

  Termination&Release終止與釋放:當A位上出現終止密碼時,釋放因子(releasingfactor,RF)進入,促進酯鍵水解,之後,tRNA和mRNA被釋放,核糖體大、小亞基解聚,解聚的大、小亞基參與下一輪翻譯過程。ribosomecycle核蛋白體迴圈:當一條多肽鏈合成結束後,核蛋白體大小兩個亞基解聚,解聚後的大小亞基可以重新參與一條新的多肽鏈的合成,這就構成了核蛋白體迴圈。molecularchaperone分子伴侶:分子伴侶是指能夠結合和穩定另外一種蛋白質的不穩定構象,並能透過有控制的結合和釋放,促進新生多肽鏈的摺疊、多聚體的裝配或降解及細胞器蛋白的跨膜運輸的一類蛋白質。

  heatshockprotein,hsp熱休克蛋白:hsp60和hsp70,前者幫助尚未摺疊或錯誤摺疊的多肽鏈形成正確的摺疊,而後者可以和新生肽鏈結合,防止其聚集,有利於正確摺疊的形成。chemicaledit化學編輯:蛋白質翻譯後新增化學基團的這一類的加工修飾方式稱為化學編輯。

  boundribosome附著核糖體:附著於內質網上的核糖體。

  freeribosome遊離核糖體:散在於胞質中核糖體。

  EndoplasmicReticulum,ER

  RER粗麵內質網:表面附著大量核糖體,以扁囊為主,少數管狀和泡狀結構;管腔與核膜腔相通,有的細胞中與核膜呈同心圓分佈,圍繞在核的周圍。

  SER滑面內質網:膜面光滑,以分支小管和小泡相互交織形成網,與RER相通。

  proteintargeting蛋白質靶向:蛋白質合成後被精確地運輸到他們行使功能的部位,這個過程稱為蛋白質的分選和運輸,又可稱為蛋白質靶向。

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