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生物資訊學課程研討式教學

生物資訊學課程研討式教學

  論文摘要:研討式教學模式將研究與討論貫穿於教學的全過程,有助於調動學生的積極性、加深對知識的理解、增進學習效果。透過確立授課目標、精心設計和組織授課內容、在實踐中不斷總結經驗,在“生物資訊學”的授課過程中對研討式教學模式進行了探索和實踐。

  論文關鍵詞:生物資訊學;課堂研討;案例分析

  21世紀是生命科學的世紀,生物技術飛速發展,生物學資料大量積累。而生物資訊學正是在這種大背景下蓬勃興起的交叉型學科,旨在用資訊學方法解決生物學問題。為了培養複合型人才,大力發展交叉學科,國防科技大學(以下簡稱“我校”)近年來面向全校理工科研究生開設了“生物資訊學”選修課程。

  “生物資訊學”作為新興的交叉學科,具有融合性、發展性和開放性的特點。融合性是指生物資訊學涉及的生物、計算機、數學等多個學科的交叉與融合。從20世紀90年代到現在,該學科發展非常迅速,研究熱點發生了數次改變。開放性是指該學科存在大量有待探索和研究的新問題。這些特點一方面為課堂教學提供了大量的主題和素材,一方面也對授課方式提出了較高的要求。經過認真分析,選定研討式教學作為該課程的主要授課方式。研討式教學即研究討論式教學,是將研究與討論貫穿於教學的全過程。在教師的具體指導下,充分發揮學生的主體作用,透過自我學習、自我教育、自我提高來獲取知識和強化能力培養。透過確立教學目標,精心設計和組織教學內容,在實踐中貫徹研討式教學理念和方法,在生物資訊學課程中對研討式教學模式進行了理論探索和實踐創新。

  一、教學目標的確立

  合理的課程目標與定位是決定課程建設成敗和教學效果的基礎,其主要依據是人才培養需求和授課物件的實際情況。首先,教學物件是研究生,已具備一定的自主學習和創新思維的能力。教師不僅要傳授知識,而且要講解基本的研究方法,讓學生具備獨立思考問題、分析問題和解決問題的能力。其次,作為軍校學生,以後從事的工作可能涉及很多學科方向,展現如何針對一門新的學科方向進行研究的整體思路顯得很有意義。最後,考慮到學生不同的知識背景,對於各部分內容的理解程度不同,必須兼顧不同的專業方向,讓每個學生都能有所收穫。因此,確立教學目標為:介紹生物資訊學的基本概念和方法,透過案例分析展現科學研究的基本方法和實踐過程。

  二、教學內容的設計和組織

  1.教學內容的總體設計

  確定了教學目標之後,需要對課程的教學內容進行總體設計。參考國內外多所高校的相關課程設定,如北京大學的“生物資訊學導論”、中科大的“生物資訊學”、中科院的“生物資訊學與系統生物學”和MIT的“Bioinformatics and Proteomics”等,發現這些課程主要是針對生物專業的學生開設,側重於方法學介紹。而我校學生大部分是工科背景,對於統計和機器學習方法有一定基礎,重點是瞭解相關的生物學問題,並應用已有的工科知識去分析和解決這些問題。同時,隨著生物資訊學的快速發展,研究領域不斷擴大,有必要展現該學科的最新進展。

  因此,課程內容總體設計上以生物學問題為主線,結合最新的研究成果,對各種計算方法的應用過程進行深入和細緻的講解。在介紹生物資訊學的研究現狀和生物學基礎知識之後,分多個專題詳述生物資訊學最新的研究進展,各專題在內容上相互銜接,由淺入深,以便學生理解和接受。以問題為導向的課程設計對於啟發學生思考,積極參與課堂研討具有重要作用。

  進一步,為了突出部分重點專題及其分析方法,採用案例分析課的形式,針對一些重要問題進行深入探討。鼓勵學生應用所學知識,結合自身的專業背景,透過積極地思考和討論提出相應的解決方案。案例選擇為教師有一定研究基礎的開放性問題,一方面介紹已有的研究成果,一方面結合教師的研究體會,透過積極討論拓展新的研究思路。案例分析課有助於學生更多地參與課堂研討,對於知識的綜合應用和科學研究過程產生切身體會。

  2.教學內容的組織

  研討式教學的關鍵是調動學生的積極性,鼓勵學生踴躍地參與課堂討論,提出自己的觀點。透過集中備課,學習和吸取老教師的成功經驗,總結調動學生積極性的基本要素,對授課內容進行了認真的組織和編排。

  (1)重點突出,詳略得當。由於生物資訊學涵蓋內容非常豐富,有必要對課程內容進行取捨,在保證知識面的基礎上,突出授課的重點。減少或刪除重要性較低的部分,採用圖片和動畫等形式對重要的知識點加以強調,以深化學生的理解。只有學生對重點內容理解透徹,才能激發出濃厚的學習興趣,積極參與課堂研討,碰撞出智慧的火花。

  (2)新穎有趣,例項豐富。在課程內容上應充分體現知識性和趣味性,以豐富的例項展現生物資訊學中基本的概念和方法。學生往往關注與日常生活休慼相關的內容,期望能用所學知識解釋常見現象,因此例項選擇應貼近生活體驗。課件中準備了大量的例項,例如,在講完構建進化樹之後,舉例說明為什麼人類的祖先是從非洲走出來的;在生物代謝一章,透過賣火柴的小女孩的故事闡釋生物代謝過程的高效性;在蛋白質結構部分,討論為什麼溼著頭髮睡覺,頭髮容易變翹。透過例項分析,增加學生對於所學知識的理解和參與課堂研討的積極性。

  (3)設定思考題,留出想象空間。針對重要的知識點,預先設定思考題,以啟發和擴充套件學生思路。生物資訊學作為一門新興學科,存在大量沒有確定結論的開放性問題,有待深入探究。例如“人類與小鼠的基因組差別很小,為什麼形態上有那麼大的差別”,“生物系統模擬中,是否越複雜的模型越好”。針對這些問題適時地開展課堂研討,有助於激發學生的學習興趣,開闊其視野。"

  三、研討式教學的開展

  在授課過程中,教師應努力營造活躍的課堂氣氛,密切觀察學生的動向,及時溝通存在的問題,選擇合適的時機開展課堂研討。不斷地積累經驗,使課堂討論達到更好的效果。在開展課堂研討時,尤其應注意以下幾點:

  1.因材施教

  在“生物資訊學”課程中,學生的專業背景不盡相同,少部分學生來自生物專業,其他大部分是工科背景,如自動化、計算機模擬和認知科學等。因此,在主題的選擇和研討環節的設計上,應充分考慮到學生的需求和背景知識,發掘大家共同的興趣點。實踐證明,不同的學科背景可以有效地促進交流,提供對於同一問題的不同視角。例如,生物專業的學生可以解釋有關生物技術的問題,而模擬專業的.學生對於系統的建模方法有深入的理解。有效的課堂討論,能夠促進各種思路的融合,碰撞出靈感的火花。

  2.及時溝通

  研討式教學需要教師對授課整體情況有較好的把握。例如,有一章的內容是生物學基礎,教師針對這部分內容進行了充分準備,包括大量的圖片和動畫,並穿插了很多科學家的故事。但授課效果不盡理想,到了預設問題的環節,只有一兩個學生參與討論,大部分學生都一臉茫然。透過及時溝通,發現了兩個問題。一是背景知識不夠,學生對於預設問題了解不多;二是重要性認識不足,學生認為生物學的基礎知識與本課程的學習關係不大。考慮到學生的疑問,對授課內容進行及時調整,進一步強調所學知識對於生物資訊學的意義,並透過具體例項激發學生的學習興趣。在例項的啟發下,學生開展了積極的討論,加深了對於所學知識的認識。開展研討式教學,應以學生為主體,及時地溝通發現課堂中存在的問題,並相應地調整授課內容。即使教師講得天花亂墜,如果學生知其然,不知其所以然,也不可能達到好的授課效果。

  3.審時度勢

  課堂研討開展的時機很重要。例如,當講到生物資訊學概況時,學生反應不是很強烈。而當教師結合自身經驗談研究體會時,學生很有興趣,表情變得活躍,適合開展課堂討論。此時,可以組織學生交流學習目的、預期和存在的疑問,以便教師進行有針對性地授課。研討式教學一方面強調學生的主體地位,一方面要求教師發揮主導作用,密切注意學生動向,發現學生的興趣點,引導討論的逐步展開和深入。

  4.自主提問

  如果教師能夠營造出一種輕鬆愉悅的課堂氛圍,學生往往能夠主動發問,提出不同觀點,而不拘泥於預先設定的問題。實踐證明,透過學生自主提問展開的課堂研討,往往效果更好。在前期鋪墊時,啟發學生自主思考並積極討論,分析該領域可能存在的問題和發展方向。當講到後續內容時,學生有了一定的心理預期,很想了解該領域的研究現狀和發展趨勢,以驗證與預期是否一致。同時,自主提問對於生物資訊學研究有很好的推動作用,學生經常能夠獨闢蹊徑,提出全新的思路,拓展研究內容的廣度和深度。

  5.課堂報告

  在授課過程中,鼓勵學生結合所學知識選擇感興趣的專題,閱讀相關文獻並進行課堂報告。由於學生的選題更接近彼此的思維方式,能夠反映一些共性的問題,對於擴充套件思路很有幫助。在報告過程中,教師可適時點評,穿插課堂討論,以深化學生對問題的理解。課堂報告可以全面地鍛鍊學生的表達能力、寫作能力和創新思維能力,提高學生的綜合素質。

  四、研討式教學效果

  在“生物資訊學”課程中,針對研討式教學的理念和方法進行了不斷地探索和實踐。課堂研討約佔總學時的三分之一,由教師根據每堂課的具體內容和學生的反應情況進行實時調整。尤其是案例分析課,課堂研討所佔比例較高,透過逐步討論,較好地再現科學研究的一般過程。學生普遍反映採用研討式教學模式,課堂氣氛活躍,對於知識的理解更加深入,具有良好的教學效果。

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